#ソースコードのダウンロード
ftp ftp://emboss.open-bio.org
> cd pub
> cd EMBOSS
> get EMBOSS-6.5.7.tar.gz
> quit
#解凍
$ tar xzvf EMBOSS-6.5.7.tar.gz
$ cd EMBOSS-6.5.7
#configureスクリプトを実行
$ ./configure
#コンパイル
$ make
#インストール
$ sudo make install
#試しに、embleからxlrhodopの塩基配列(Xenopus laevis rhodopsin mRNA, complete cds)を取得する。
$ seqret
Read and write (return) sequences
Input (gapped) sequence(s): embl:xlrhodop
output sequence(s) [l07770.fasta]:
kappa-no-MacBook:120806 kappa$ ls
l07770.fasta
>L07770 L07770.1 Xenopus laevis rhodopsin mRNA, complete cds.
ggtagaacagcttcagttgggatcacaggcttctagggatcctttgggcaaaaaagaaac
acagaaggcattctttctatacaagaaaggactttatagagctgctaccatgaacggaac
agaaggtccaaatttttatgtccccatgtccaacaaaactggggtggtacgaagcccatt
cgattaccctcagtattacttagcagagccatggcaatattcagcactggctgcttacat
gttcctgctcatcctgcttgggttaccaatcaacttcatgaccttgtttgttaccatcca
gcacaagaaactcagaacacccctaaactacatcctgctgaacctggtatttgccaatca
cttcatggtcctgtgtgggttcacggtgacaatgtacacctcaatgcacggctacttcat
ctttggccaaactggttgctacattgaaggcttctttgctacacttggtggtgaagtggc
cctctggtcactggtagtattggccgttgaaagatatatggtggtctgcaagcccatggc
caacttccgattcggggagaaccatgctattatgggtgtagccttcacatggatcatggc
tttgtcttgtgctgctcctcctctcttcggatggtccagatacatcccagagggaatgca
atgctcatgcggagtagactactacacactgaagcctgaggtcaacaatgaatcctttgt
tatctacatgttcattgtccacttcaccattcccctgattgtcatcttcttctgctatgg
tcgcctgctctgcactgtcaaagaggctgcagcccagcaacaggaatctgctaccaccca
gaaggctgagaaagaggtcaccagaatggttgttatcatggtcgttttcttcctgatctg
ttgggtgccctatgcctatgtggcattctacatcttcacccaccagggctctaactttgg
cccagtcttcatgaccgtcccagctttctttgccaagagctctgctatctacaatcctgt
catctacattgtcttgaacaaacagttccgtaactgcttgatcaccaccctgtgctgtgg
aaagaatccattcggtgatgaagatggctcctctgcagccacctccaagacagaagcttc
ttctgtctcttccagccaggtgtctcctgcataagagcttcaccagggctgtctcagggt
ccgctgcctcacacaattcccatcacttaagccctgtctacttgttgcgaaggcaaagaa
ttccacagttttaatatttacccccattctgcccaaccttggacactgtaagagctgacc
ccattactgctgggaaggcccaagctttgttgcattctgatgtgatcctttcagcagaaa
atgggtggattcaatgaatttcaccaaggctgtacataacaataacattagtctgaaggc
acctcccacccagagaatgcaacacttatttatctctgtcttttcttgacatattgatgc
tgcttctattcatggtcactaacaaaaagtcccattttacaatgcaactgaaagtaatgt
atttttgtaatataataacatatttcatgcaatctcctctgcttattggcaaggtctgat
atagtgaggatagacagccagaccccttgcattaaaatcctgtattaaaaatttctttgc
aagt
