cdrecordというアプリケーションを使います。
#APTパッケージマネージャーを用いたcdrecordのインストール
$ sudo apt-get install cdrecord
#ubuntu64bitのisoイメージファイルの置いてあるディレクトリに移動
$ cd /home/kappa/Downloads
#cdrecordが認識しているハードウェアを調べる
$ cdrecord -scanbus
scsibus2:
2,0,0 200) 'MATSHITA' 'DVD-RAM UJ-833S ' '1.51' Removable CD-ROM
2,1,0 201) *
2,2,0 202) *
2,3,0 203) *
2,4,0 204) *
2,5,0 205) *
2,6,0 206) *
2,7,0 207) *
#isoイメージをDVD-Rに焼く
$ cdrecord dev=2,0,0 ubuntu-11.04-<F12>desktop-amd64.iso
lubuntuでのスクリーンショット
軽量化を求めてlubuntuに移ってきたわけだが、lubuntuは軽量化を推し進めている関係でいくつかの機能がデフォルトでは落とされてしまっている。
そのひとつがスクリーンショットである。
synaptic package マネージャーから”screen shot" と検索して、検索結果の下の方にある
xfce4-screenshooter をインストールすればOKです！
端末からなら、
$ sudo apt-get install xfce4-screenshooter
でインストール可能です(^^)
そのひとつがスクリーンショットである。
synaptic package マネージャーから”screen shot" と検索して、検索結果の下の方にある
xfce4-screenshooter をインストールすればOKです！
端末からなら、
$ sudo apt-get install xfce4-screenshooter
でインストール可能です(^^)
htmlファイルの編集ソフト : KompoZer
vimのようなシンプルなテキストエディターだけでhtmlを書いていると時間がかかってしょうがないので、KompoZerというhtmlファイル編集のお助けソフトを使うことがあります。
#KompoZer のインストール
$ sudo apt-get install kompozer
#kompozerの起動
$ kompozer ファイル名.html &
これで編集できます♪♪
かなり楽ですよ！！
#KompoZer のインストール
$ sudo apt-get install kompozer
#kompozerの起動
$ kompozer ファイル名.html &
これで編集できます♪♪
かなり楽ですよ！！
htmlファイルをgftpを使ってサーバーへアップロード♪
Windowsでホームページ作るときによく使うffftp。
#####################################################
Wikipediaより引用
FFFTPは、1997年に曽田純(Sota)が作成、発表した、代表的なFTPクライアントソフトウェア。開発は現在も続けられている。漢字などのマルチバイト文字を名前に含むファイルを扱えるのが特徴。
#####################################################
ubuntuでは、このffftpは使えませんが、その代わりにgFTPというFTPクライアントソフトウェアが存在します。
http://gftp.seul.org/
#インストールは
$ sudo apt-get install gftp
#アプリケーションの起動は、
$ gftp &
#ためしにごく簡単なhtmlファイルを作成します。
$ vim test.html
1 <html>
2 <head>
3 <title>
4 Hello!!
5 </title>
6 </head>
7 <body>
8 This is my first home page.
9 </body>
10 </html>
#内容をウェブブラウザ（今回はfirefox)で確認するには
$ firefox test.html
#gftp起動
$ gftp &
FC２で作成したホスト名（ユーザー名.web.fc2.com)と、ユーザー名とパスワード（FC2全体のパスワードではなく、ホームページを作成した時に作成したパスワードであることに注意）を入力してあげればOKです。ただし、一番右の項目はFTPを選択します。
ちなみに、私のHPのURLは
http://kappabucha.web.fc2.com/
です(^^)
お時間がありましたら遊びにきてください♪
#####################################################
Wikipediaより引用
FFFTPは、1997年に曽田純(Sota)が作成、発表した、代表的なFTPクライアントソフトウェア。開発は現在も続けられている。漢字などのマルチバイト文字を名前に含むファイルを扱えるのが特徴。
#####################################################
ubuntuでは、このffftpは使えませんが、その代わりにgFTPというFTPクライアントソフトウェアが存在します。
http://gftp.seul.org/
#インストールは
$ sudo apt-get install gftp
#アプリケーションの起動は、
$ gftp &
#ためしにごく簡単なhtmlファイルを作成します。
$ vim test.html
1 <html>
2 <head>
3 <title>
4 Hello!!
5 </title>
6 </head>
7 <body>
8 This is my first home page.
9 </body>
10 </html>
#内容をウェブブラウザ（今回はfirefox)で確認するには
$ firefox test.html
#gftp起動
$ gftp &
FC２で作成したホスト名（ユーザー名.web.fc2.com)と、ユーザー名とパスワード（FC2全体のパスワードではなく、ホームページを作成した時に作成したパスワードであることに注意）を入力してあげればOKです。ただし、一番右の項目はFTPを選択します。
ちなみに、私のHPのURLは
http://kappabucha.web.fc2.com/
です(^^)
お時間がありましたら遊びにきてください♪
EMBOSSを使って、塩基配列を操作。プライマーの設計。
homo sapiens のVEGFA（vascular endothelial growth factor A isoform a）をネタにEMBOSSを使い倒してみる。
#Refseqの配列のuniform sequence address, 名前、アクッセンション番号、核酸配列orアミノ酸配列、配列の長さ、gcの割合、配列の説明を取得
$ infoseq
Display basic information about sequences
Input (gapped) sequence(s): refseq:NM_001025366
USA Database Name Accession Type Length %GC Organism Description
refseq-id:NM_001025366 refseq NM_001025366 NM_001025366 N 3677 51.26 Homo sapiens (human) Homo sapiens vascular endothelial growth factor A (VEGFA), transcript variant 1, mRNA.
#一行でテキストファイルに出力してしまなら
$ infoseq refseq:NM_001025366 -outfile=NM_001025366_infoseq.txt
Reads and writes (returns) sequences
Input (gapped) sequence(s): refseq:NM_001025366
output sequence(s) [nm_001025366.fasta]: NM_001025366.nt
#seqretコマンドを使って塩基配列を取り出す。
Reads and writes (returns) sequences
Input (gapped) sequence(s): refseq:NM_001025366
output sequence(s) [nm_001025366.fasta]: NM_001025366.nt
#一行で書くなら
$seqret refseq:NM_001025366 -outseq NM_001025366
#NM_001025366を毎回入力するのがめんどくさい場合は、テキストファイルの中に
#refseq:NM_001025366と書いたものを用意して、@＋ファイル名でseqretの引数に加えてやればよい。この方法だと、複数の配列をテキストファイルの中に書いておけば、一度に複数の配列をダウンロードしてくることができる。
$ seqret @NM_001025366.txt -outseq=NM_001025366
#配列以外の情報もすべてゲットしたいときは、entretコマンドがおすすめ。
$ entret @NM_001025366.txt -outfile=NM_001025366.entret
#配列のアノテーションが書かれているfeatureの部分を可視化するには,showfeatコマンド
$ showfeat @NM_001025366.txt -outfile=NM_001025366.entret
#Refseqの配列のuniform sequence address, 名前、アクッセンション番号、核酸配列orアミノ酸配列、配列の長さ、gcの割合、配列の説明を取得
$ infoseq
Display basic information about sequences
Input (gapped) sequence(s): refseq:NM_001025366
USA Database Name Accession Type Length %GC Organism Description
refseq-id:NM_001025366 refseq NM_001025366 NM_001025366 N 3677 51.26 Homo sapiens (human) Homo sapiens vascular endothelial growth factor A (VEGFA), transcript variant 1, mRNA.
#一行でテキストファイルに出力してしまなら
$ infoseq refseq:NM_001025366 -outfile=NM_001025366_infoseq.txt
Reads and writes (returns) sequences
Input (gapped) sequence(s): refseq:NM_001025366
output sequence(s) [nm_001025366.fasta]: NM_001025366.nt
#seqretコマンドを使って塩基配列を取り出す。
Reads and writes (returns) sequences
Input (gapped) sequence(s): refseq:NM_001025366
output sequence(s) [nm_001025366.fasta]: NM_001025366.nt
#一行で書くなら
$seqret refseq:NM_001025366 -outseq NM_001025366
#NM_001025366を毎回入力するのがめんどくさい場合は、テキストファイルの中に
#refseq:NM_001025366と書いたものを用意して、@＋ファイル名でseqretの引数に加えてやればよい。この方法だと、複数の配列をテキストファイルの中に書いておけば、一度に複数の配列をダウンロードしてくることができる。
$ seqret @NM_001025366.txt -outseq=NM_001025366
#配列以外の情報もすべてゲットしたいときは、entretコマンドがおすすめ。
$ entret @NM_001025366.txt -outfile=NM_001025366.entret
#配列のアノテーションが書かれているfeatureの部分を可視化するには,showfeatコマンド
$ showfeat @NM_001025366.txt -outfile=NM_001025366.entret
登録:
投稿 (Atom)