Bioinformaticsのお勉強

ウィーン大学で生命科学者をしている今鉄男と申します。生命の尊さ、美しさがどのようなメカニズムで生じるのかに興味があります。科学の方法論を用いて、このような問いに応えたい、私はこう思って医学生物学の基礎研究のトレーニングを受けてきました。生命を科学的手法を用いて理解を試みる上で、genomeを始めとした種々の大量データの処理が必要不可欠であることを痛感しました。また、生命科学が物理学、数学、統計学、有機化学などの種々の学問と深い関わりを持つことを実感しました。そのため、このブログは広範囲の学問領域に関しての記事を載せています。日々の学習内容を文書に書き残し、それを読み返すことによって、体系化された知識を身に付けることを目標としています。どうぞよろしくお願いします。

二群比較と回帰分析の関係

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今回は二群比較と回帰分析の関係について考えたいと思います。 前回のブログでは、ANOVAと二群比較が共に「目的とする効果による変動が誤差による変動に対して有意に大きいか」という発想を根底に持つという意味で共通しているのだという議論を行いました。 実は、回帰分析と二群比較も同...

二群比較とANOVAの関係

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今回は、平均値の二群比較が、対応の無い2群の一元配置分散分析を行うことに等しいことを直感的に理解することを目指します。 今、CityAとCityBに住んでいる住人をそれぞれの群から無作為に6人だけ選出して身長を測定したとします。それが以下のデータです。 このデータに対して...

霊長類の進化

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先週、愛知県犬山市にある日本モンキーセンター( http://www.j-monkey.jp/ )を見学してきました。様々な種類の霊長目の動物達が活発に動き回る姿を目の当たりにして、私たちヒトという動物の生きる意味について問い直すきっかけとなりました。 さて、今回は霊長目(霊...

Rを用いた単回帰分析の基本

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ある試薬を培養細胞に添加したときのある遺伝子の発現量を制御するための実験を行った。実験結果は以下の通りである。このデータを用いて単回帰分析を行う。 以下解析。 #Rを起動 $ R #データの入力 x <- c(0.1, 0.2,0.3,0.4,0.5,...

生物界の分類をFreemindで整理してみた!

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【参考文献】 井出利憲「分子生物学講義中継 生物の多様性と進化の驚異」羊土社 2010 32pp
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kappa
生命科学系の研究者をしています。UNIXのシンプルな体系に魅了されました。医学や生物に興味を持っています。情報科学、生物学、医学、物理学等の学習内容の備忘録として、このブログを作成しました。
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