Bioinformaticsのお勉強

ウィーン大学で生命科学者をしている今鉄男と申します。生命の尊さ、美しさがどのようなメカニズムで生じるのかに興味があります。科学の方法論を用いて、このような問いに応えたい、私はこう思って医学生物学の基礎研究のトレーニングを受けてきました。生命を科学的手法を用いて理解を試みる上で、genomeを始めとした種々の大量データの処理が必要不可欠であることを痛感しました。また、生命科学が物理学、数学、統計学、有機化学などの種々の学問と深い関わりを持つことを実感しました。そのため、このブログは広範囲の学問領域に関しての記事を載せています。日々の学習内容を文書に書き残し、それを読み返すことによって、体系化された知識を身に付けることを目標としています。どうぞよろしくお願いします。

スパコンにまつわる統計

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スパコンの計算速度を基準としたランキングは、世間をにぎわせています。 このランキングは、Top500( http://www.top500.org/ )にて閲覧、データダウンロードが可能です。 今回はこのサイトで実装されている解析機能を利用してスパコンに関する様々な統計( ...

Mac OS XのFilesystem Hierarchy

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Mac OS XはUNIXベースのOSであることは周知の事実である。 Mac OS XはUNIXベースでありながら、Filesystem HierarchyはLinuxのそれとは若干異なっている。 詳しくは、 https://developer.apple.com/lib...

Filesystem Hierarchy Standard(FHS)

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今回は、UNIX系OSのファイルシステムの標準規格であるFilesystem Hierarchy Standard(FHS)  http://www.pathname.com/fhs/  について勉強しました。 FHSの目標はabstractにある以下の文章によって表現されてい...

UNIXコマンドのまとめ

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UNIXコマンドをFreemindを用いて系統的にまとめました。 【参考文献】 林晴比古『Linux/UNIX入門』2000 SOFT BANK Publishing v - xx pp

Freemindで生物情報を階層化して整理

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生物学の情報を整理する時は、「階層化」という方法を頻繁に用います。 今回は、Freemindというツールを用いて医学生物学の種々の学問領域間の関係性を描写してみました。 #インストールは下のサイトからインストラーをダウンロード http://freemind.sourc...
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生命科学系の研究者をしています。UNIXのシンプルな体系に魅了されました。医学や生物に興味を持っています。情報科学、生物学、医学、物理学等の学習内容の備忘録として、このブログを作成しました。
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